More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1495 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  100 
 
 
113 aa  221  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  68.47 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  63.96 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  65.77 
 
 
112 aa  148  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  62.16 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  59.63 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  61.82 
 
 
112 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  60.18 
 
 
113 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  60.18 
 
 
113 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  60 
 
 
112 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  54.95 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  59.63 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.72 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  55.75 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 
127 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  57.8 
 
 
178 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  57.8 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  58.18 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  53.98 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  55.96 
 
 
168 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  51.2 
 
 
127 aa  124  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
229 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 
120 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  51.38 
 
 
151 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 
117 aa  120  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
195 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
195 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
195 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
202 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
116 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 
120 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
180 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 
190 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  54.55 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  57.41 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 
128 aa  117  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 
146 aa  117  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  52.21 
 
 
161 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 
127 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
116 aa  116  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 
179 aa  116  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  45.95 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  52.78 
 
 
179 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  52.29 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  50.93 
 
 
203 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 
122 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
116 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 
141 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  51.85 
 
 
268 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
190 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01348  50S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G09410)  54.05 
 
 
211 aa  114  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  47.75 
 
 
113 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  56.7 
 
 
144 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 
118 aa  114  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  52.5 
 
 
121 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  48.82 
 
 
128 aa  114  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 
116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 
116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  51.75 
 
 
208 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
176 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  50.93 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  46.83 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  52.78 
 
 
222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>