More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0224 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  100 
 
 		 113 aa  226  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  60.71 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  62.16 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  62.16 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  54.17 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  54.17 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  53.1 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 168 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  51.15 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  51.33 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  53.57 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.79 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  51.64 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  50 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  50.89 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  56.12 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  48.67 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  50 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  50.91 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  52.73 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  50.89 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  48.21 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>