More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1456 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  78.74 
 
 		 127 aa  206  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  69.53 
 
 		 128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  67.97 
 
 		 128 aa  176  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  66.14 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  69.05 
 
 		 120 aa  169  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  69.05 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  61.07 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  67.19 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  64.29 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  63.49 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  63.49 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  58.73 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  59.52 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  50.79 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  53.17 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  50.39 
 
 		 113 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  50.79 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  51.59 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  47.24 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  52.03 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 203 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  47.24 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 113 aa  117  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 116 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  46.03 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  49.18 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  45.97 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  49.18 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  49.18 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  47.11 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  48.39 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 184 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  45.6 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  47.24 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  45.53 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  46.83 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  44.72 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  42.28 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0788  50S ribosomal protein L17  42.2 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00196591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  44.26 
 
 		 202 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  45.08 
 
 		 268 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  46.03 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  44.26 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  44.26 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  44.26 
 
 		 233 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  45.97 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  44.26 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  44.35 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  46.72 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  43.31 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>