More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0669 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
119 aa  243  4e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  75.63 
 
 
119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 
120 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 
120 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  51.94 
 
 
128 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  51.94 
 
 
128 aa  130  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 
127 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  53.66 
 
 
126 aa  120  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 
127 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.89 
 
 
155 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0253  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 
112 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  47.06 
 
 
113 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  44.17 
 
 
131 aa  110  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  46.72 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 
178 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  48.31 
 
 
116 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  47.06 
 
 
112 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 
112 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  44.64 
 
 
168 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  45.54 
 
 
184 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  44.64 
 
 
127 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
172 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  47.9 
 
 
113 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  42.61 
 
 
137 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  44.54 
 
 
113 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  43.7 
 
 
113 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  43.7 
 
 
113 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  41.96 
 
 
118 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  47.71 
 
 
151 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  42.98 
 
 
208 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  45.38 
 
 
113 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  47.17 
 
 
116 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  42.34 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  44.66 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  43.48 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  45.37 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 
176 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  41.44 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  44.54 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  40.54 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  49.06 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  41.07 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  43.1 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  42.62 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  42.34 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  45.54 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  43.1 
 
 
169 aa  94.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  47.17 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  45.05 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  40 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  40 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  46.23 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  40.54 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  46.22 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  47.17 
 
 
138 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  43.24 
 
 
128 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  43.4 
 
 
140 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
138 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  42.61 
 
 
146 aa  93.6  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  41.44 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  42.34 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  44.83 
 
 
247 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  43.24 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  40.54 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  39.5 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  39.29 
 
 
170 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  40.18 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 
140 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  39.64 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 
113 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
138 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.96 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  40.18 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  44.64 
 
 
131 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  41.07 
 
 
222 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf409  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  41.38 
 
 
195 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  41.96 
 
 
190 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>