More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2374 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  78.12 
 
 		 128 aa  201  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  77.34 
 
 		 128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  69.84 
 
 		 120 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  69.05 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  68.22 
 
 		 127 aa  169  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  67.19 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  67.46 
 
 		 127 aa  164  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 122 aa  154  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  67.46 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  67.46 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  62.31 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  61.11 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  53.66 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  52.38 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  51.2 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  51.2 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  54.76 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  52.38 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  53.6 
 
 		 116 aa  120  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 178 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  51.2 
 
 		 143 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  48 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  51.2 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  48.41 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  52.03 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  49.21 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  51.59 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  49.6 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  47.15 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  46.83 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.39 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  48.78 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 208 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  46.83 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  45.24 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01348  50S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G09410)  48 
 
 		 211 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  47.15 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  48.39 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  48.39 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  47.97 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  48.78 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  48.36 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  45.53 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  46.03 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>