More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0480 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 117 aa  236  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  95.73 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  94.87 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 184 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 178 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  50.44 
 
 		 113 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  50 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  41.38 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  51.02 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  46.83 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 208 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  44.04 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  44.83 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  39.32 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  49.04 
 
 		 197 aa  103  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  43.48 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  45.76 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  44.8 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>