More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19801 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  87.07 
 
 		 116 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  84.48 
 
 		 116 aa  205  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  86.21 
 
 		 116 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  84.48 
 
 		 116 aa  204  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  85.34 
 
 		 116 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  85.34 
 
 		 116 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  84.48 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  83.62 
 
 		 116 aa  200  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 116 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  73.91 
 
 		 116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  69.83 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  69.83 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  68.97 
 
 		 116 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0227  50S ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0224  50S ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0023231  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  60.34 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  62.07 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  50.49 
 
 		 203 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  51.92 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  49.18 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  50 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 195 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 195 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 195 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  50.5 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  48.72 
 
 		 268 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  48.08 
 
 		 202 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  45.37 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  50.96 
 
 		 190 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  47.57 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  44.95 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  44.95 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  44.95 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  49.04 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  44.86 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  46.53 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  50.96 
 
 		 197 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  49.04 
 
 		 219 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  50 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 183 aa  98.6  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  48.11 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  48.11 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 178 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 208 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  43.93 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 128 aa  96.7  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  48.11 
 
 		 183 aa  95.9  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  44.66 
 
 		 233 aa  95.9  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  48.08 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 116 aa  95.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 120 aa  95.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  44.04 
 
 		 202 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  42.62 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  43.59 
 
 		 169 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 247 aa  94  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  43.59 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  41.88 
 
 		 195 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  49.04 
 
 		 222 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>