More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_445 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  100 
 
 		 117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  97.44 
 
 		 117 aa  234  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  94.87 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  51.79 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  43.97 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  50 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  48.67 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  46.55 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  52.04 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  50.49 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 208 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  41.88 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 197 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  45.22 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01348  50S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G09410)  49.09 
 
 		 211 aa  104  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  103  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  103  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>