More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1256 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  46.01 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  52.1 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 113 aa  124  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 140 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 113 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  48.2 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  52.14 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 132 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 139 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  50.86 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0354  ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.194755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 132 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  52.21 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>