More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0254 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  66.07 
 
 		 113 aa  163  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  67.86 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  63.96 
 
 		 113 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  61.61 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  63.96 
 
 		 113 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  63.96 
 
 		 113 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  61.47 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  57.5 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  56.67 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  57.8 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  55.12 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  57.38 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  60.82 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  50.89 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.36 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 229 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  52.34 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  53.57 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  52.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 179 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  58.18 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  51.59 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 137 aa  120  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  53.57 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 137 aa  120  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  51.33 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  56.25 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 190 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 168 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 208 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  54.13 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  52.29 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  54.05 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  54.76 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>