More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0792 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  54.69 
 
 		 175 aa  141  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 124 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 131 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.03 
 
 		 127 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  48.48 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 131 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  52.14 
 
 		 137 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 141 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 112 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 131 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 133 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  48.48 
 
 		 146 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 112 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 130 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 112 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  51.28 
 
 		 127 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  52.14 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 128 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  45.59 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  42.95 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  49.57 
 
 		 126 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  45.67 
 
 		 136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 112 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  45.26 
 
 		 139 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  50.43 
 
 		 132 aa  118  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1863  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.82 
 
 		 138 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 113 aa  117  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 132 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 128 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 128 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 132 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 130 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>