More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1863 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1863  ribosomal protein L17  100 
 
 
128 aa  259  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 
179 aa  118  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  42.62 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
168 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  42.02 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 
112 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  45.05 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 
127 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  43.59 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
178 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  43.59 
 
 
168 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 
126 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  41.27 
 
 
126 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 
126 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  40.34 
 
 
155 aa  105  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
184 aa  105  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
175 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0458  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00945035  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0519  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0710013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  44.44 
 
 
128 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
158 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  40.48 
 
 
131 aa  104  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 
132 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  38.1 
 
 
126 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  41.88 
 
 
162 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  42.74 
 
 
183 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  41.88 
 
 
164 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  41.86 
 
 
129 aa  103  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
132 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 
132 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 
132 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  39.67 
 
 
143 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 
131 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  41.03 
 
 
163 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  39.34 
 
 
146 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  42.06 
 
 
127 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 
127 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 
132 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  41.22 
 
 
166 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  40.98 
 
 
140 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 
129 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 
129 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 
129 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  43.1 
 
 
130 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
131 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 
141 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  40.17 
 
 
128 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 
190 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 
125 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 
128 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  40 
 
 
151 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 
140 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  41.88 
 
 
129 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  37.82 
 
 
138 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  40.34 
 
 
138 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  41.03 
 
 
132 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  43.59 
 
 
151 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  41.88 
 
 
129 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  40.17 
 
 
156 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  38.1 
 
 
126 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
131 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
130 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 
119 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  37.82 
 
 
138 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
130 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  37.82 
 
 
138 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  38.52 
 
 
139 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.88 
 
 
137 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  39.34 
 
 
141 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
152 aa  100  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  40 
 
 
140 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  38.89 
 
 
130 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  40 
 
 
131 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  36.72 
 
 
141 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  38.66 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  40.34 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  41.54 
 
 
129 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  40.34 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  36.89 
 
 
139 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  42.2 
 
 
190 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  36.89 
 
 
139 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  40.34 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  38.52 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
128 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  40.98 
 
 
141 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  39.67 
 
 
132 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  38.89 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  36.43 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  39.5 
 
 
141 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  39.68 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  39.34 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  37.9 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  39.02 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>