More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3135 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 156 aa  319  9.000000000000001e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  67.59 
 
 		 160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  64.63 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  66.42 
 
 		 194 aa  191  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  62.67 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  59.24 
 
 		 159 aa  186  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  59.33 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  55.7 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  62.32 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  55 
 
 		 161 aa  170  9e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  58.73 
 
 		 226 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  47.55 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  55.37 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  55 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 125 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  55 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  53.72 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  51.47 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  46.21 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  55.56 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 172 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  55 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  49.26 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  55 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 128 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  53.72 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  51.67 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 152 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>