More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1910 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 160 aa  326  9e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  67.33 
 
 		 183 aa  200  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  72.46 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  64.38 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  62.05 
 
 		 183 aa  197  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  63.35 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  67.59 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  62 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  56.6 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  68.07 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  60 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  49.67 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  44.79 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  54.7 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  51.09 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 127 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 126 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  52.07 
 
 		 126 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  46.31 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  48.51 
 
 		 134 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  51.67 
 
 		 134 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 130 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  51.28 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 130 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 136 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 132 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 128 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  48.72 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  52.99 
 
 		 131 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 127 aa  121  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  44.97 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 119 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>