More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0317 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  85.03 
 
 		 147 aa  250  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  83.55 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  79.74 
 
 		 154 aa  246  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  78.91 
 
 		 166 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  80.92 
 
 		 172 aa  227  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  76.71 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  49.67 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  47.14 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  47.71 
 
 		 183 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 194 aa  127  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 226 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  43.87 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  48.97 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  44.97 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  45.32 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 219 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  44.9 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 202 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 204 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  47.24 
 
 		 229 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 268 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  47.06 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 178 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.21 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  48.21 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  38.89 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  45.24 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  50 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  38.12 
 
 		 190 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 233 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  42.47 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  47.71 
 
 		 222 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  43.7 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  42.96 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  45.74 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  45.67 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 202 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  46.49 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  46.43 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>