More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1506 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  58.12 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  51.11 
 
 		 194 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  53.38 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  55.56 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  46.67 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  52.54 
 
 		 183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  46.32 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 183 aa  123  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  45.59 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0262  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  47.79 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  52.54 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  46.32 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  44.36 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  43.61 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 202 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  47.73 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  46.51 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  44.36 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 204 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  52.63 
 
 		 183 aa  116  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  52.68 
 
 		 229 aa  115  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 161 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  48.78 
 
 		 169 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  51.75 
 
 		 190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  47.33 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  50.44 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  44.12 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  51.33 
 
 		 179 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  50 
 
 		 268 aa  113  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  50.79 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  46.56 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  49.21 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  48.87 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 176 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  50 
 
 		 203 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  48.87 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>