More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0262 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0262  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 121 aa  243  8e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0743  ribosomal protein L17  51.26 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 171 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  45 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  43.22 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  45.45 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 204 aa  106  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.43 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  45 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  42.5 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  47.37 
 
 		 202 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  44.92 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  44.17 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  44.17 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  44.17 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  44.17 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  42.98 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 226 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  43.41 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  42.73 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  43.22 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0354  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.194755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  42.5 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>