More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0200 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  100 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  47.02 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  46.29 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  51.94 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  48 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  43.79 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  43.37 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  42.11 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  45.06 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  46.36 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  49.64 
 
 		 138 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0262  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  46.5 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  48.57 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  49.23 
 
 		 136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  48.84 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  45.33 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  50.42 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  45.32 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  44.65 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  42.59 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 226 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  52 
 
 		 117 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  48.44 
 
 		 141 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  44.37 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  44.24 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  42.14 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  43.12 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  41.51 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  42.33 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  43.04 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  45.74 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  48.44 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  42.14 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  48.44 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  43.04 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  42.04 
 
 		 136 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  42.68 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  43.07 
 
 		 139 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 140 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  49.23 
 
 		 128 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  49.23 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 132 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  42.04 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  42.04 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  45.06 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  43.85 
 
 		 124 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  45.71 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  45.24 
 
 		 133 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 219 aa  98.2  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  44.68 
 
 		 133 aa  98.2  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 117 aa  97.8  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  46.56 
 
 		 129 aa  97.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  46.56 
 
 		 129 aa  97.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  44.96 
 
 		 139 aa  97.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  47.01 
 
 		 268 aa  97.4  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  45.24 
 
 		 117 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  38.61 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>