More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1321 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1109  50S ribosomal protein L17  59.84 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000625282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0982  50S ribosomal protein L17  62.1 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0761  ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  40.77 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  42.06 
 
 		 176 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  44 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  41.54 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  44.54 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  42.52 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  44 
 
 		 226 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  43.2 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  40 
 
 		 159 aa  94.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  40.32 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  40.32 
 
 		 117 aa  93.6  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  38.84 
 
 		 114 aa  93.2  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  39.85 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  38.28 
 
 		 194 aa  92.8  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  43.2 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  37.69 
 
 		 222 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  37.3 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  40.32 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  42.4 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  39.2 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  40.32 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  42.4 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 229 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  40.8 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  40.8 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  38.4 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  39.52 
 
 		 208 aa  90.5  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  37.1 
 
 		 202 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  38.4 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  39.71 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  39.52 
 
 		 190 aa  90.1  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  38.4 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 190 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  41.6 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  36.8 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  38.4 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  37.1 
 
 		 219 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  40.68 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  39.52 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  38.71 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 203 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  34.62 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  38.46 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  35.88 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 175 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  38.4 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  35.11 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  36 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  37.6 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  38.28 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  41.6 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  41.6 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  40 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  41.6 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  41.6 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>