More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0204 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  87.29 
 
 		 118 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  82.76 
 
 		 117 aa  200  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  81.03 
 
 		 117 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  81.03 
 
 		 117 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 117 aa  191  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  75 
 
 		 116 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1007  50S ribosomal protein L17  82.83 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.168469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1750  50S ribosomal protein L17  80.81 
 
 		 99 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00132391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  50 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  48 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  50 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 132 aa  119  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 114 aa  116  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  46.43 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 190 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  46.15 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  47.86 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 183 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  45.3 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 194 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  45.3 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  44.55 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  45.52 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>