More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3978 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  52.24 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  50.75 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  45.32 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  48.51 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 178 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  49.25 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  45.52 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  49.25 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0519  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0710013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0458  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00945035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  45.19 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  45.52 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  45.52 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  48.51 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  47.76 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  48.51 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  48.51 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  47.01 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  48.51 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  46.27 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  45.52 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  45.67 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  45.19 
 
 		 208 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  45.52 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  41.86 
 
 		 233 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  45.67 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  45.99 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  46.76 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  40.3 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  46.04 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  46.04 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  45.99 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  40.3 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  43.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  46.04 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  39.55 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  40.3 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  45.93 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>