More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2038 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  63.79 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  64.91 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  61.21 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  57.89 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  55.26 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.63 
 
 		 155 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  50.75 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  52.42 
 
 		 128 aa  121  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.85 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.46 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  48.87 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  50.39 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  51.69 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  48.41 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 184 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  50.85 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  48.09 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  44.93 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  48.51 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 208 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  47.27 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  43.51 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  48.31 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  43.51 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  50 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  45.74 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  44.27 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  47.24 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  49.15 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  48.31 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  44.8 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  45.31 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  45.31 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  45.31 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>