More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0106 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  87.18 
 
 		 133 aa  210  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  81.2 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  72.65 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  59.83 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  57.89 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  51.97 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  48.44 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  52.31 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  49.62 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  51.16 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  48.87 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  48.87 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  50.78 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  48.48 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  47.66 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  48.33 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  49.19 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  49.17 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  50.38 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  49.62 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  47.73 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  48.82 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 124 aa  120  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 168 aa  120  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  50.81 
 
 		 124 aa  120  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  46.67 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  47.37 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48.84 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  49.22 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  45.86 
 
 		 132 aa  117  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>