More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0222 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
127 aa  250  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  78.74 
 
 
127 aa  206  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  75.78 
 
 
128 aa  192  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  72.66 
 
 
128 aa  184  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  69.29 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
120 aa  167  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
120 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  62.12 
 
 
131 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  67.46 
 
 
126 aa  153  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  61.11 
 
 
122 aa  148  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  60.32 
 
 
112 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  62.2 
 
 
122 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  62.2 
 
 
122 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  57.94 
 
 
121 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 
113 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 
113 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 
112 aa  130  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  53.97 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  51.18 
 
 
113 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  49.6 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  51.2 
 
 
113 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 
178 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 
127 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 
119 aa  123  1e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  52.38 
 
 
112 aa  120  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
112 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.59 
 
 
168 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  53.23 
 
 
155 aa  119  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  46.46 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.79 
 
 
184 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 
119 aa  118  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  51.22 
 
 
113 aa  116  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  46.83 
 
 
143 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  47.24 
 
 
113 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 
146 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  47.2 
 
 
116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 
152 aa  110  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  45.53 
 
 
151 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  48.03 
 
 
140 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  45.24 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  48.36 
 
 
203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  45.9 
 
 
117 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 
208 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  46.03 
 
 
137 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  43.44 
 
 
181 aa  107  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  46.28 
 
 
116 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  47.15 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  47.54 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  44.78 
 
 
125 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 
138 aa  105  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 
116 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  46.77 
 
 
142 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  44 
 
 
138 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 
166 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  43.9 
 
 
229 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  45.97 
 
 
139 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 
116 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  47.32 
 
 
144 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  43.09 
 
 
172 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 
116 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
117 aa  104  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 
117 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  45.9 
 
 
116 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 
141 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  44.8 
 
 
117 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  44.8 
 
 
117 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  43.09 
 
 
136 aa  103  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  46.34 
 
 
170 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
154 aa  103  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 
116 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
118 aa  103  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  45.53 
 
 
117 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3638  50S ribosomal protein L17  38.64 
 
 
178 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000734422  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 
141 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  46.77 
 
 
126 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 
179 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  42.06 
 
 
142 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 
116 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>