More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8720 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  100 
 
 
116 aa  236  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 
116 aa  170  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 
116 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  69.83 
 
 
116 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 
116 aa  160  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  66.38 
 
 
116 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  64.66 
 
 
116 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  63.79 
 
 
116 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  63.79 
 
 
116 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 
116 aa  154  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 
116 aa  153  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 
116 aa  151  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 
116 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 
116 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 
116 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  60.34 
 
 
116 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  59.48 
 
 
145 aa  149  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  68.1 
 
 
116 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0227  50S ribosomal protein L17  66.38 
 
 
116 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0224  50S ribosomal protein L17  66.38 
 
 
116 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0023231  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 
112 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
113 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
113 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 
127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
141 aa  113  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  48.82 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 
208 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  43.1 
 
 
116 aa  110  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  45.69 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 
172 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  48.65 
 
 
113 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
184 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
178 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  45.6 
 
 
127 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
141 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  48.65 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  49.57 
 
 
117 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 
116 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  47.41 
 
 
139 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 
132 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  45.22 
 
 
140 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  50.94 
 
 
179 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  47.41 
 
 
140 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
161 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
130 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  45.05 
 
 
112 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
130 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
132 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  47.71 
 
 
114 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  43.97 
 
 
131 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  43.1 
 
 
168 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  46.15 
 
 
126 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 
175 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
140 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
119 aa  102  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 
141 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 
139 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 
139 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 
117 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  44.14 
 
 
113 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.97 
 
 
151 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 
146 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
138 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
142 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
137 aa  100  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  46.61 
 
 
120 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
116 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  47.12 
 
 
202 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
138 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
141 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>