More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2996 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1157  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 116 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758306  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3998  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 116 aa  168  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.290769  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4941  50S ribosomal protein L17  67.24 
 
 		 115 aa  146  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0743  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 226 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  50 
 
 		 161 aa  110  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 208 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  46.55 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  47.86 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  45.69 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  43.97 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  46.55 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  44.83 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 117 aa  100  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  43.93 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 183 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>