More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4941 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4941  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3998  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.290769  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  67.24 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1157  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758306  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  116  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 184 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 155 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  46.55 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  47.41 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  43.97 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0743  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 128 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 226 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>