More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1157 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1157  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758306  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3998  50S ribosomal protein L17  93.97 
 
 		 116 aa  221  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.290769  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 116 aa  169  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4941  50S ribosomal protein L17  65.52 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0743  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 226 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 161 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  45.69 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  43.97 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 125 aa  94  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  43.59 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 128 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 138 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  40.52 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  41.03 
 
 		 247 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  44.8 
 
 		 171 aa  90.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>