More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2987 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 116 aa  186  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  75.65 
 
 		 116 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 116 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0227  50S ribosomal protein L17  82.76 
 
 		 116 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0224  50S ribosomal protein L17  82.76 
 
 		 116 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0023231  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 116 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 116 aa  176  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  69.83 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  69.83 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  69.83 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 116 aa  173  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  65.52 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  56.03 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 113 aa  116  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 161 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 180 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  44.83 
 
 		 202 aa  105  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  45.08 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 219 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 190 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  49.07 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  44.83 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 183 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  47.41 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>