More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3874 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  82.79 
 
 		 190 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  80.16 
 
 		 169 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 229 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  63.01 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  79.66 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  79.66 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  76.23 
 
 		 164 aa  202  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  79.66 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  56.35 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  77.97 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  81.36 
 
 		 180 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  65.84 
 
 		 168 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  77.12 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  77.97 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  61.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  73.73 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  73.02 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  54.79 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  69.23 
 
 		 268 aa  187  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  62.33 
 
 		 189 aa  187  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  55.49 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  52.91 
 
 		 190 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  64.93 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  70.69 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  75.42 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  64.49 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  64.06 
 
 		 170 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  60.69 
 
 		 144 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  52.75 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  66.1 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  67.8 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  71.55 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  67.8 
 
 		 190 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  50.3 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  53.24 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  49.61 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  54.39 
 
 		 118 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  48.03 
 
 		 152 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 184 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 112 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  48.89 
 
 		 169 aa  128  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  40.64 
 
 		 247 aa  128  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  42.57 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 114 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  42.76 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 112 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  59.26 
 
 		 117 aa  121  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  57.43 
 
 		 113 aa  121  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 		 124 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 113 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 113 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  48.41 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  56.7 
 
 		 144 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 136 aa  118  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  46.61 
 
 		 121 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 156 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  45.28 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 112 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 147 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  43.95 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 141 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  46.92 
 
 		 140 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  45.38 
 
 		 143 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 116 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 140 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 123 aa  113  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 138 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  42.18 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 116 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 120 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.43 
 
 		 126 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>