More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  69.95 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  61.24 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  72.79 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  55.22 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  57.98 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  58.01 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  56.11 
 
 		 242 aa  184  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  66.42 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  66.15 
 
 		 202 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  65.15 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  64.47 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  57.96 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  63.45 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  65.41 
 
 		 176 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  61.38 
 
 		 268 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  57.67 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  63.31 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  52.22 
 
 		 172 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  57.33 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  65.47 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 190 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  52.63 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  54.22 
 
 		 203 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  47.18 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  56.67 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  58.46 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  53.95 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  53.95 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  53.95 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  59.23 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  58.46 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  48.09 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  57.25 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  54.94 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  57.69 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  44 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  41.21 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  45.74 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  43.41 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  39.51 
 
 		 151 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  40.15 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  45.9 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  39.85 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  45.04 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  42.97 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 117 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  42.42 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  41.61 
 
 		 124 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  45 
 
 		 121 aa  101  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  40.13 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  44.36 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  42.62 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  44 
 
 		 118 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 		 137 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  44.17 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  40.15 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 144 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  48.08 
 
 		 116 aa  99  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  44.17 
 
 		 120 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  37.96 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 113 aa  98.2  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  40.96 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  41.67 
 
 		 138 aa  98.2  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  38.8 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 120 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 113 aa  97.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 113 aa  97.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  41.8 
 
 		 141 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  41.09 
 
 		 138 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  41.86 
 
 		 141 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  40.56 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  41.46 
 
 		 112 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  39.26 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 128 aa  95.5  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 128 aa  95.1  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  41.67 
 
 		 113 aa  95.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 142 aa  94.4  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  41.67 
 
 		 113 aa  94  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  40.62 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 139 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  40.91 
 
 		 133 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  40.98 
 
 		 114 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>