More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0208 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
172 aa  336  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  80.92 
 
 
152 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  83.1 
 
 
147 aa  235  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  77.63 
 
 
154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  81.69 
 
 
151 aa  229  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  78.17 
 
 
152 aa  224  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  70.3 
 
 
166 aa  221  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  47.27 
 
 
160 aa  137  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  55.83 
 
 
226 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  45.86 
 
 
194 aa  136  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  50.71 
 
 
156 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  47.56 
 
 
161 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  46.55 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 
163 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  52.85 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  50.69 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  55.08 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  54.63 
 
 
202 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  48.12 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  48.89 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  48.89 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  48.89 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  49.28 
 
 
203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  42.07 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  50 
 
 
114 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  47.66 
 
 
222 aa  117  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  41.46 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  51.3 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  53.7 
 
 
219 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 
155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  50.43 
 
 
117 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 
120 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  52.29 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  51.85 
 
 
268 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 
120 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  49.15 
 
 
121 aa  110  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  47.86 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  46.03 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 
184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  50.46 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  47.01 
 
 
168 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  44.31 
 
 
196 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  50 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  45.9 
 
 
129 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  45.9 
 
 
129 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 
122 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
132 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  44.63 
 
 
138 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
138 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 
197 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  47.71 
 
 
112 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
132 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
136 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
140 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  44.8 
 
 
127 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  48.7 
 
 
233 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
131 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  47.37 
 
 
164 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 
122 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  43.61 
 
 
141 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  46.28 
 
 
170 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 
138 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 
122 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
138 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
131 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 
137 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  46.51 
 
 
140 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  49.07 
 
 
189 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  46.03 
 
 
134 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  46.28 
 
 
162 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  47.86 
 
 
128 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
118 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  47.2 
 
 
132 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  47.41 
 
 
116 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
135 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>