More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2803 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  100 
 
 
195 aa  380  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  81.69 
 
 
169 aa  234  5.0000000000000005e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  86.78 
 
 
247 aa  229  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1132  ribosomal protein L17  70.4 
 
 
161 aa  185  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.087473  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  49.25 
 
 
155 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  43.35 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  42.46 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  44.69 
 
 
202 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  45.7 
 
 
203 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  45.26 
 
 
168 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  43.3 
 
 
196 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 
197 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
190 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  41.04 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  46.22 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  39.41 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  47.01 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
195 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
195 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
195 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  45.83 
 
 
178 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  41.4 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.85 
 
 
126 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  50.88 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  43.11 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  41.4 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  46.15 
 
 
169 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  45.11 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  48.21 
 
 
176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 
127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  41.61 
 
 
151 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  43.18 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  45.54 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 
141 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  48.76 
 
 
121 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  43.14 
 
 
152 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 
133 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  43.7 
 
 
176 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  45.3 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  42.63 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  42.55 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.72 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  40.79 
 
 
144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  48.25 
 
 
233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
124 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  45 
 
 
164 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 
138 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  39.18 
 
 
242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  42.74 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  43.88 
 
 
131 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 
112 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  41.4 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  47.86 
 
 
139 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  44.03 
 
 
141 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
140 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  41.3 
 
 
140 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
140 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  45.97 
 
 
142 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  43.22 
 
 
208 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  44.92 
 
 
117 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
120 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  49.57 
 
 
117 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  45.97 
 
 
142 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 
141 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
116 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 
120 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  45.97 
 
 
142 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  43.94 
 
 
146 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
120 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  43.33 
 
 
136 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
190 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  45.11 
 
 
166 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  43.31 
 
 
134 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  46.67 
 
 
131 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
132 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 
170 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 
140 aa  104  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  48.18 
 
 
112 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  38.26 
 
 
138 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  44.7 
 
 
140 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
132 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 
112 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  37.58 
 
 
138 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 
138 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  45.97 
 
 
138 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 
135 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>