More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3112 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  79.07 
 
 		 168 aa  247  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  64.1 
 
 		 202 aa  224  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  87.9 
 
 		 178 aa  224  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  79.23 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  73.33 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  80 
 
 		 196 aa  207  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  71.22 
 
 		 144 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  77.17 
 
 		 164 aa  204  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  62.57 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  64.67 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  77.87 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  70.5 
 
 		 181 aa  198  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  58.15 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  76.92 
 
 		 176 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  68.89 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  73.38 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  77.5 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  66.01 
 
 		 203 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  72.99 
 
 		 190 aa  194  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  81.1 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 196 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  58 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  67.63 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  68.12 
 
 		 176 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  63.82 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  55.91 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  73.11 
 
 		 183 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  53.33 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  74.62 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  63.28 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  68.64 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  66.95 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  65.06 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  52.31 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  46.45 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 127 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  47.1 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  57.41 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  61.39 
 
 		 113 aa  124  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  53.98 
 
 		 118 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 114 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 144 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 112 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  46.77 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 112 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.43 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 137 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 140 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 117 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  44.81 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  46.03 
 
 		 141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 121 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 142 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.91 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  54.39 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 113 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 113 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  49.56 
 
 		 128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  49.53 
 
 		 127 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  55.67 
 
 		 113 aa  111  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.94 
 
 		 140 aa  111  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  52.48 
 
 		 135 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 138 aa  111  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 126 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 126 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  51.49 
 
 		 138 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 		 129 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 126 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 140 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>