More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3668 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  82.35 
 
 		 195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  82.35 
 
 		 195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  82.35 
 
 		 195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  63.68 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  79.39 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  83.87 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  82.26 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  56.22 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  64.71 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 229 aa  197  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  62.81 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  65.28 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  76.47 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  56.98 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  69.7 
 
 		 190 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  74.58 
 
 		 169 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  55.38 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 176 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  66.42 
 
 		 268 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  57.71 
 
 		 168 aa  178  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  58.24 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  67.2 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  59.24 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  61.27 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  65.62 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  66.13 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  56.94 
 
 		 144 aa  164  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  58.39 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  58.46 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  67.38 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  62.71 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  58.87 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  62.4 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  57.02 
 
 		 118 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  56.36 
 
 		 114 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  57.41 
 
 		 112 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  51.03 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  56.64 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  50.69 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  62.38 
 
 		 113 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  51.77 
 
 		 151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  56.64 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  48.97 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 116 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  56.25 
 
 		 184 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  56.07 
 
 		 116 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.07 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  56.14 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  52.03 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 117 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  52.85 
 
 		 141 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 112 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 		 127 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 		 154 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 140 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 127 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 135 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  55.14 
 
 		 116 aa  118  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 116 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  47.55 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  41.4 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  48.55 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 112 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 126 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 137 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  53.27 
 
 		 116 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 136 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  53.64 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  44.65 
 
 		 159 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  50.91 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  46.04 
 
 		 139 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  52.03 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 138 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  47.76 
 
 		 140 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  51.69 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  53.7 
 
 		 131 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 113 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 113 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 116 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 128 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>