More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0594 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  83.58 
 
 		 176 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  87.6 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  84.75 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  56.12 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  57.58 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  56.93 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  78.69 
 
 		 168 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  64.91 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  63.37 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  77.87 
 
 		 164 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  80.17 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  57.61 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  78.45 
 
 		 222 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  76.23 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  64.1 
 
 		 203 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  74.58 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  75.42 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  70.15 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 176 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  56.68 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  66.42 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  65.97 
 
 		 144 aa  185  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  56.47 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  70.34 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 180 aa  178  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  65.6 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  63.78 
 
 		 233 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  67.8 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  62.86 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  69.17 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  55.26 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  55.17 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  46.5 
 
 		 175 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  55.26 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.37 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  57.66 
 
 		 112 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 178 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  57.27 
 
 		 114 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  40.31 
 
 		 247 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 127 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  46.21 
 
 		 151 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  52.54 
 
 		 121 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  46.62 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  57.84 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  55.36 
 
 		 117 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 113 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 113 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  61.11 
 
 		 117 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  58.42 
 
 		 113 aa  121  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 		 124 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  40.46 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 156 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  45.91 
 
 		 159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  44.3 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 151 aa  117  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  50.42 
 
 		 136 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  54.9 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 133 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  44.78 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.91 
 
 		 143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  52.34 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 137 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.15 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  44.14 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  46.02 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  49.56 
 
 		 128 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 140 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.25 
 
 		 131 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 120 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  49.57 
 
 		 126 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>