More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5153 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  100 
 
 
179 aa  356  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  74.86 
 
 
172 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  82.05 
 
 
229 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  67.97 
 
 
222 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  60.2 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  80.17 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  61.18 
 
 
170 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  63.35 
 
 
190 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  75.4 
 
 
168 aa  187  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  59.54 
 
 
196 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  61.96 
 
 
190 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  56.57 
 
 
202 aa  183  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  73.28 
 
 
202 aa  183  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  74.14 
 
 
268 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  75 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  70.4 
 
 
219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  70.4 
 
 
176 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  70.59 
 
 
176 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  76.67 
 
 
206 aa  180  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  75 
 
 
178 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  63.58 
 
 
203 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  54.64 
 
 
195 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  54.64 
 
 
195 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  54.64 
 
 
195 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  65.89 
 
 
189 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  73.28 
 
 
164 aa  175  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  68.97 
 
 
202 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  70.69 
 
 
180 aa  167  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  67.24 
 
 
144 aa  166  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  63.12 
 
 
195 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  70.31 
 
 
196 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  64.84 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  66.94 
 
 
242 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  68.97 
 
 
183 aa  162  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  62.31 
 
 
233 aa  161  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  62.5 
 
 
180 aa  158  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  68.1 
 
 
199 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  54.61 
 
 
175 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  47.51 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  62.16 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  50.34 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  57.52 
 
 
118 aa  136  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 
155 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  59.46 
 
 
184 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 
112 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 
112 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  65.66 
 
 
144 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 
140 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 
138 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 
127 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 
124 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 
142 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  53.6 
 
 
126 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  57.41 
 
 
112 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 
141 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  54.7 
 
 
117 aa  127  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.55 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  60.4 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 
140 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  51.61 
 
 
141 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  53.15 
 
 
128 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 
137 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  52.76 
 
 
138 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 
141 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  54.95 
 
 
143 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  55.96 
 
 
113 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.96 
 
 
114 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  50.75 
 
 
140 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
113 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 
113 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  49.22 
 
 
134 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  55.56 
 
 
112 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
138 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  50.39 
 
 
140 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
142 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
142 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 
142 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 
140 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  51.54 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  52.78 
 
 
112 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  46.38 
 
 
141 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>