More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2939 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 190 aa  241  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  79.41 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  81.45 
 
 		 197 aa  215  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  73.33 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  80.65 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  59.5 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 172 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  65.56 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 144 aa  193  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  70 
 
 		 268 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  56.11 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 229 aa  185  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  65.47 
 
 		 180 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  56.5 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  72.44 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  58.56 
 
 		 179 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  61.59 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  56.04 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  70.59 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  69.17 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  62 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  63.43 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  64.49 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  59.28 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  67.21 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  66.1 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  57.89 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  58.87 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  53.89 
 
 		 233 aa  161  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  45.96 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  45.96 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  45.96 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  51.24 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  66.15 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  46.24 
 
 		 183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  47.93 
 
 		 247 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.18 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  45.73 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  48.72 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  44.8 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  51.35 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  48.32 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  50.44 
 
 		 118 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  47.27 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  57.41 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  48.7 
 
 		 137 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.74 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 113 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  44.72 
 
 		 140 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 		 140 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 140 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  43.05 
 
 		 156 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  47.83 
 
 		 142 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 127 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 142 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  46.96 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 138 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 142 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  44.72 
 
 		 141 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 142 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  39.73 
 
 		 151 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  43.67 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  44.72 
 
 		 139 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  46.23 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 138 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  49.5 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  43.9 
 
 		 139 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  48.15 
 
 		 112 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  48.18 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  46.3 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  49.5 
 
 		 138 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 		 141 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 137 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 124 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  47.37 
 
 		 137 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 140 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  46.49 
 
 		 128 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 		 130 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  45.53 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>