More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1132 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1132  ribosomal protein L17  100 
 
 		 161 aa  323  9e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.087473  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  73.77 
 
 		 247 aa  192  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  68.42 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  70.4 
 
 		 195 aa  184  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  40.88 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  45.59 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  48.78 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  44.54 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 208 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  41.94 
 
 		 202 aa  103  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  43.24 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  41.32 
 
 		 268 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  41.46 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  41.46 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  41.46 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  38.22 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  41.22 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  42.36 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  39.26 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  42.42 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  41.96 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  45.87 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  45.45 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  42.02 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  41.53 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  44.54 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  40.6 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  42.02 
 
 		 197 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  42.48 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  42.42 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  39.47 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  42.42 
 
 		 140 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  41.35 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 120 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  45.67 
 
 		 126 aa  97.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  41.67 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  41.96 
 
 		 229 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  38.52 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  43.22 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  44.25 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  46.79 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  42.42 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  40.91 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  39.84 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  42.98 
 
 		 202 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  44 
 
 		 128 aa  94.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 116 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 121 aa  94.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  41.56 
 
 		 196 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  42.11 
 
 		 180 aa  94  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  40.68 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  39.55 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  43.12 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  43.2 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  45.67 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  43.86 
 
 		 199 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 116 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 116 aa  91.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 116 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 116 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  42.02 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  40.77 
 
 		 233 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  44.07 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  40.62 
 
 		 141 aa  90.9  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  37.82 
 
 		 194 aa  90.9  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  44.72 
 
 		 127 aa  90.9  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  42.34 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  41.53 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  42.2 
 
 		 112 aa  90.5  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  38.1 
 
 		 189 aa  90.5  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  43.12 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  39.69 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>