More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29223 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29223  Plastid ribosomal protein L17 large ribosomal subunit  100 
 
 		 145 aa  300  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  64.35 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  63.79 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8720  predicted protein  59.48 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  63.79 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  148  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  61.21 
 
 		 116 aa  147  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  62.93 
 
 		 116 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  62.93 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  61.21 
 
 		 116 aa  144  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  61.21 
 
 		 116 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0227  50S ribosomal protein L17  61.21 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0224  50S ribosomal protein L17  61.21 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0023231  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  50.93 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  46.72 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  45.97 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  42.24 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  43.97 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 178 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 168 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  44.26 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  45.37 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2996  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 208 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  42.24 
 
 		 134 aa  93.6  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3998  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.290769  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>