More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2291 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
122 aa  239  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
122 aa  239  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  95.9 
 
 
122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  74.59 
 
 
120 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  73.77 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  72.95 
 
 
120 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  68.99 
 
 
128 aa  159  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  66.41 
 
 
128 aa  157  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  63.49 
 
 
127 aa  150  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  62.2 
 
 
127 aa  147  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  67.46 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  63.93 
 
 
112 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  62.3 
 
 
112 aa  143  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  59.84 
 
 
121 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  58.27 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  56.92 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  57.02 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  57.02 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  57.38 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  55.74 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 
112 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  56.56 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  52.46 
 
 
113 aa  123  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  52.46 
 
 
113 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  54.62 
 
 
113 aa  120  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.46 
 
 
114 aa  119  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  51.22 
 
 
119 aa  120  9e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.26 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  52.89 
 
 
116 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  52.1 
 
 
175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 
178 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  52.1 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  52.1 
 
 
141 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 
184 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  54.03 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  52.54 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  53.78 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  50.41 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  49.18 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  49.58 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.58 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48.33 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  47.97 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  50.85 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 
142 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 
140 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 
135 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 
140 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  45.83 
 
 
142 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 
141 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 
140 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  47.9 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  48.33 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  47.93 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  49.18 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  50.85 
 
 
116 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  48.36 
 
 
140 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 
140 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  51.26 
 
 
126 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01348  50S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G09410)  49.17 
 
 
211 aa  106  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  49.58 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 
139 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  50.41 
 
 
131 aa  105  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  48.76 
 
 
139 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 
172 aa  105  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48.74 
 
 
139 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  50.41 
 
 
129 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 
131 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  50.42 
 
 
116 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  48.74 
 
 
152 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 
131 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  50.47 
 
 
144 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  49.59 
 
 
131 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
116 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  51.26 
 
 
126 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  47.93 
 
 
131 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>