More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3638 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3638  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 178 aa  353  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000734422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0788  50S ribosomal protein L17  48.63 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00196591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2933  50S ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  39.77 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  38.2 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  38.2 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  40.45 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  38.64 
 
 		 127 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  39.43 
 
 		 120 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  39.89 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  38.29 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  38.29 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  38.29 
 
 		 112 aa  98.2  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 120 aa  97.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  38.51 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  38.64 
 
 		 112 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  38.86 
 
 		 112 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  37.5 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  36.78 
 
 		 113 aa  92  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  35.39 
 
 		 113 aa  91.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  37.57 
 
 		 121 aa  90.9  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  34.27 
 
 		 113 aa  90.9  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  36.21 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  33.91 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  35.63 
 
 		 127 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  35.06 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  35.8 
 
 		 122 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  34.66 
 
 		 112 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  35.43 
 
 		 113 aa  88.6  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  35.06 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  37.85 
 
 		 127 aa  88.2  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  35.84 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  35.06 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  35.23 
 
 		 112 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  37.36 
 
 		 139 aa  84.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  36.93 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  34.09 
 
 		 116 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2374  50S ribosomal protein L17  37.93 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  36.93 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  32.76 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  34.48 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  34.66 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2590  50S ribosomal protein L17  35.56 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000445959  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  33.91 
 
 		 133 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  31.82 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  35.8 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  33.33 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  32.39 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  31.82 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  31.82 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  35.06 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  31.21 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  34.09 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  32.39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  30.11 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  33.52 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  31.79 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  33.52 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  33.91 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  31.79 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  32.76 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  32.18 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0253  50S ribosomal protein L17  30.34 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  28.32 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  32.18 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  31.25 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  34.09 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  31.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  33.95 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  32.39 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  31.61 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  32.18 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  31.03 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  30.86 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  31.21 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  30.46 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  31.21 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  32.57 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  30.64 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  34.86 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  30.34 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  27.75 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  31.21 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  32.95 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  32.18 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  29.21 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  29.48 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  32.18 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  32.56 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  30.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>