More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2933 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2933  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 174 aa  357  7e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0788  50S ribosomal protein L17  72.99 
 
 		 174 aa  269  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00196591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3638  50S ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000734422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 113 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 		 113 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  37.06 
 
 		 112 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  36.84 
 
 		 120 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  36.26 
 
 		 120 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  32.76 
 
 		 113 aa  96.3  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  35.47 
 
 		 112 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  36.42 
 
 		 121 aa  94  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  36.63 
 
 		 116 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  34.12 
 
 		 112 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  35.88 
 
 		 112 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  35.47 
 
 		 122 aa  91.3  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  34.48 
 
 		 113 aa  91.3  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  34.68 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  35.88 
 
 		 113 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  35.29 
 
 		 122 aa  88.2  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  35.29 
 
 		 122 aa  88.2  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  34.66 
 
 		 127 aa  87.8  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  33.14 
 
 		 112 aa  87.8  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  33.91 
 
 		 114 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  33.14 
 
 		 116 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  33.53 
 
 		 112 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  31.61 
 
 		 113 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  32.35 
 
 		 131 aa  84.7  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  31.36 
 
 		 222 aa  84  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  31.67 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  32.54 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  32.78 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0317  50S ribosomal protein L17  32.95 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.09582e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  31.95 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  32.02 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  31.36 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  31.36 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  33.53 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  30.23 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  31.95 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  30 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  29.65 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  30.81 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  30.18 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  29.41 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  31.74 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  30.18 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  32.16 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  29.07 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  31.36 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  31.36 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  29.07 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  29.24 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  31.36 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  30.77 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  33.33 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  31.18 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  32.37 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  30.18 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  31.14 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  30.77 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  31.95 
 
 		 203 aa  73.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  31.74 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2208  50S ribosomal protein L17  29.76 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0514  50S ribosomal protein L17  30.18 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  33.72 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  30.77 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  29.41 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  31.07 
 
 		 268 aa  72  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  28.24 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1627  50S ribosomal protein L17  29.17 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  27.22 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17421  50S ribosomal protein L17  29.17 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4941  50S ribosomal protein L17  30.59 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1105  50S ribosomal protein L17  28.4 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19801  50S ribosomal protein L17  28.4 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  31.58 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  31.58 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  30.54 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17261  50S ribosomal protein L17  29.17 
 
 		 116 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  27.65 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  32.34 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  31.18 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17161  50S ribosomal protein L17  29.17 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  28.24 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  28.82 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  31.36 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2590  50S ribosomal protein L17  33.14 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000445959  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  27.06 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  31.64 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  32.35 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>