More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0253 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0253  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  44.54 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  46.22 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf409  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  42.02 
 
 
112 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 
132 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  46.23 
 
 
130 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  46.23 
 
 
130 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  42.15 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 
131 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  40.5 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  41.44 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  38.76 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
129 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
130 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  43.7 
 
 
113 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.96 
 
 
137 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  41.23 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  41.38 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  47.17 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  44.74 
 
 
133 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  42.34 
 
 
132 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  42.28 
 
 
122 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  38.66 
 
 
113 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  38.66 
 
 
113 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  43.9 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  37.21 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0792  50S ribosomal protein L17  38.79 
 
 
179 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  38.66 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  41.96 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  43.1 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  41.96 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  38.39 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  39.66 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  47.17 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  41.18 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  42.98 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  42.86 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  43.24 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  37.01 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  41.38 
 
 
132 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  39.64 
 
 
127 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
130 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
132 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  43.52 
 
 
134 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  40.52 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  41.07 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  39.64 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  41.46 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  42.98 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  40.18 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  44.34 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  43.4 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  37.82 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>