More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf409 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf409  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
121 aa  248  3e-65  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  51.96 
 
 
114 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  49.11 
 
 
112 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  51.79 
 
 
112 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  50.48 
 
 
179 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  53.47 
 
 
172 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  54.9 
 
 
112 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
120 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  46.28 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  53.92 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
127 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  49.52 
 
 
233 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  51.96 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl151  50S ribosomal protein L17  45.54 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.405073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  54.9 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  48.51 
 
 
202 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  51 
 
 
203 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0621  50S ribosomal protein L17P  44.25 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  50.98 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  48 
 
 
170 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0253  50S ribosomal protein L17  47.22 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  45.61 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  48 
 
 
219 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1456  50S ribosomal protein L17  44.95 
 
 
127 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  48.04 
 
 
116 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  45.1 
 
 
113 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  45.54 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  46.43 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.98 
 
 
184 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  45.54 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  44.64 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  47.52 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  48.51 
 
 
190 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  46.96 
 
 
121 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2987  50S ribosomal protein L17  45.45 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0222  50S ribosomal protein L17  44.95 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  44.63 
 
 
128 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  50.54 
 
 
199 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0669  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  44.64 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  49 
 
 
202 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  46 
 
 
229 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  49.02 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3728  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
116 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  44.64 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  46.08 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  49.02 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  45.1 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  47 
 
 
195 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  47 
 
 
195 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  44.64 
 
 
133 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  47 
 
 
195 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  48.51 
 
 
180 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1317  50S ribosomal protein L17  48.04 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  41.96 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  44.64 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.07 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  45.54 
 
 
222 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0503  50S ribosomal protein L17  48.25 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000331122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  47.52 
 
 
190 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  49.5 
 
 
176 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_445  ribosomal protein L17  48.25 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  42.86 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2584  50S ribosomal protein L17  47.06 
 
 
116 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  48 
 
 
202 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0480  50S ribosomal protein L17  44.74 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000309842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  44.64 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  43.14 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  46.53 
 
 
190 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>