More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4006 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3329  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.77 
 
 
258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1019  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.93 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0964  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.93 
 
 
244 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3340  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.93 
 
 
251 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191011  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.22 
 
 
249 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0950  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.93 
 
 
251 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.52 
 
 
243 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3671  TonB system transport protein ExbB1  59.72 
 
 
260 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.98 
 
 
264 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00466749  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  45.54 
 
 
232 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  44.28 
 
 
232 aa  171  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0326  TonB system transport protein ExbB1  43.52 
 
 
228 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000984448  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1752  TonB system transport protein ExbB1  41.87 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00726097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.76 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  33.9 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.6 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.71 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.64 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.76 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.97 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.95 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  28.33 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  27.33 
 
 
206 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.62 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  37.37 
 
 
470 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  28.11 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  28.65 
 
 
474 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.97 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.2 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.16 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.15 
 
 
480 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.75 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  35.71 
 
 
460 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  29.05 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.14 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1853  biopolymer transport exbB protein  33.7 
 
 
203 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 
208 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.17 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.97 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0507  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.25 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.66 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.79 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.79 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.79 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35 
 
 
457 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.49 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.21 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.64 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.59 
 
 
462 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.27 
 
 
226 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.56 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  35.85 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  36.21 
 
 
180 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  26.16 
 
 
465 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  32.56 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.41 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  35.85 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.32 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.08 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
488 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  37.5 
 
 
144 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  27.75 
 
 
454 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.64 
 
 
457 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  33.08 
 
 
453 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.07 
 
 
455 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  27.38 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  30.29 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  29.7 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.42 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 
451 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>