More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0326 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0326  TonB system transport protein ExbB1  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000984448  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  73.68 
 
 
232 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  70.54 
 
 
232 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1752  TonB system transport protein ExbB1  59.42 
 
 
226 aa  208  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00726097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
244 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3329  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.66 
 
 
258 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.4 
 
 
243 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0964  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 
244 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3671  TonB system transport protein ExbB1  42.79 
 
 
260 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1019  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.41 
 
 
249 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 
264 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00466749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0950  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
251 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3340  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
251 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.52 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  31.06 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
196 aa  72  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.89 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.89 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.72 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.13 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.76 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 
339 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.32 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.87 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.05 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  29.47 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.54 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.79 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.12 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.56 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.89 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.57 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.19 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  41.94 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  38.71 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  38.71 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.83 
 
 
324 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.53 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.32 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  38.78 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  38.78 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.49 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  38.78 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.17 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.3 
 
 
457 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0443122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.98 
 
 
469 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.44 
 
 
455 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  43.75 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  40.21 
 
 
455 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.09 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.88 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.85 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  35.87 
 
 
453 aa  58.5  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.8 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.4 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  40.91 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  40.91 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  35.48 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.83 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.62 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.06 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  26.86 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.38 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  35.87 
 
 
451 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.17 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.13 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.73 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  29.65 
 
 
313 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  29.45 
 
 
465 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  27.43 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>