More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3329 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3329  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.77 
 
 
244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1019  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.97 
 
 
251 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3340  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.7 
 
 
251 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191011  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.3 
 
 
249 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0950  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.62 
 
 
251 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3671  TonB system transport protein ExbB1  56.87 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.87 
 
 
243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0964  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.79 
 
 
244 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  45.53 
 
 
232 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  47.6 
 
 
232 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.73 
 
 
264 aa  175  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00466749  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0326  TonB system transport protein ExbB1  44.76 
 
 
228 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000984448  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1752  TonB system transport protein ExbB1  43.35 
 
 
226 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00726097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.32 
 
 
216 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.08 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.09 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.49 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.05 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  30.57 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
231 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  32.96 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.94 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.28 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  30.34 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.03 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.52 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.03 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.56 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.89 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.35 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.35 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.58 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.25 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.95 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  30.05 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.38 
 
 
208 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1853  biopolymer transport exbB protein  32.07 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.55 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
210 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.26 
 
 
457 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  27.75 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.34 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  27.32 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  27.32 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.52 
 
 
209 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  32.53 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.91 
 
 
227 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  31.14 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.48 
 
 
469 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
207 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  28.87 
 
 
454 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  29.23 
 
 
464 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.69 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.63 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.12 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.32 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.48 
 
 
470 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  32.43 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.81 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  35.05 
 
 
460 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.03 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 
201 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.65 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.87 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  37.25 
 
 
208 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.64 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.64 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.56 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.12 
 
 
480 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  26.92 
 
 
474 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 
171 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  34.38 
 
 
144 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  33.58 
 
 
451 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.08 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  54.93 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.14 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.38 
 
 
488 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.62 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.51 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  27.47 
 
 
465 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.94 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>