More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.37 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.37 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69 
 
 		 284 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.19 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.53 
 
 		 285 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.43 
 
 		 282 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.49 
 
 		 284 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.16 
 
 		 284 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  51.44 
 
 		 288 aa  294  9e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.48 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 		 286 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  51.65 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  52.21 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.55 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.55 
 
 		 285 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 		 285 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  49.65 
 
 		 288 aa  288  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  50.35 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  49.65 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  50 
 
 		 291 aa  285  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  52.94 
 
 		 334 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.8 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 		 287 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.46 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.83 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.73 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 		 286 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  50 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.08 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  50.35 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  50.37 
 
 		 337 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 		 285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  49.45 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  48.91 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  50 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.07 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 		 284 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 		 285 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 		 280 aa  264  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 		 286 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 285 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>