More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4586 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.44 
 
 
282 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.43 
 
 
284 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.74 
 
 
285 aa  358  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.92 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.92 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 
285 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.36 
 
 
284 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.49 
 
 
281 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
285 aa  301  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
285 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
288 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
285 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
285 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
293 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
285 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
286 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
285 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
311 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
285 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
286 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
297 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
285 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
284 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.94 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
286 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
285 aa  269  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
286 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
300 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
286 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
287 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
286 aa  268  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
306 aa  267  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.73 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
288 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
286 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
288 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.12 
 
 
284 aa  265  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 
296 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  48.94 
 
 
285 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 
287 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
297 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
288 aa  262  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  48.56 
 
 
337 aa  261  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
285 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
298 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  46.4 
 
 
288 aa  260  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
284 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
288 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
308 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  46.72 
 
 
291 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
286 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  47.48 
 
 
291 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.01 
 
 
296 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  48.19 
 
 
294 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  48.19 
 
 
294 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  48.19 
 
 
294 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  48.19 
 
 
294 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  47.1 
 
 
288 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  47.1 
 
 
288 aa  255  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  47.1 
 
 
288 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  47.1 
 
 
288 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  47.08 
 
 
288 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
288 aa  255  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
297 aa  254  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.48 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
288 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3340  oxidoreductase  47.83 
 
 
294 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  49.82 
 
 
297 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 
293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
285 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
288 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  47.43 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 
317 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  47.1 
 
 
298 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
299 aa  249  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
285 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
285 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
299 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  47.1 
 
 
294 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.21 
 
 
286 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  46.74 
 
 
294 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  46.74 
 
 
294 aa  248  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
282 aa  248  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  46.74 
 
 
294 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  46.74 
 
 
294 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  44.44 
 
 
286 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
294 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.87 
 
 
280 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  46.01 
 
 
288 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  46.38 
 
 
294 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
285 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>